Pero no se en que se diferencia con la instalacion embbebed (prefered)

He encontrado una memoria SD de 4gb HCD o algo asi, lo que quiero es instalar el SO en esa memoria y dejar el disco entero para los datos, de esa forma cuando tenga que reformatear el sistema los datos no se me eliminen.
En resumen, que diferencia hay entre una instalacion embebida con una instalacion full?
Saludos
